מבקר המדינה בודק האם המפלגות בכנסת והגורמים המתמודדים במערכות הבחירות בישראל מנהלים את חשבונותיהם על פי החוק והנחיות המבקר
אחד מתפקידיו של מבקר המדינה הוא לערוך ביקורת על החשבונות של המפלגות המתמודדות בבחירות לכנסת, של הסיעות והרשימות המתמודדות בבחירות לרשויות המקומיות, של המועמדים לראשות המועצות האזוריות ושל המועמדים המתמודדים בבחירות המקדימות במפלגות השונות. כמו כן מבקר המדינה עורך ביקורת על החשבונות השוטפים של המפלגות המיוצגות בכנסת.
הכנסת העניקה למבקר המדינה סמכויות ביקורת בחוקים שונים:
- מתוקף חוק מימון מפלגות, בודק מבקר המדינה כיצד המפלגות בכנסת מנהלות את ענייניהן הכספיים השוטפים וכיצד הסיעות ורשימות המועמדים אשר מתמודדות בבחירות לכנסת מתנהלות מבחינה כספית בתקופת הבחירות. בנוסף, בודק מבקר המדינה את אופן התנהלותו של גוף חוץ-מפלגתי אשר מבצע פעילות בחירות ("גוף פעיל בבחירות").
- מתוקף חוק הרשויות המקומיות (מימון בחירות) בודק מבקר המדינה את ענייניהן הכספיים של הסיעות והרשימות שהשתתפו בבחירות לרשויות המקומיות ושל המועמדים לראשי מועצות אזוריות שהתמודדו בבחירות.
- חוק המפלגות הקנה למבקר המדינה את הסמכות לבדוק את חשבונותיהם של מועמדים בבחירות מקדימות במפלגות השונות (פריימריז). בנוסף, ומכוח חוק המפלגות, בודק מבקר המדינה את התנהלותו הכספית של אדם שהודיע ברבים על כוונתו להתמודד בבחירות לכנסת במסגרת מפלגה שהוא אינו חבר בה.
בחוקים הללו ובהנחיות שמפרסם מבקר המדינה נקבעו כללים ומגבלות המוטלים על המתמודדים במערכות הבחירות השונות.
כחלק מהביקורת בוחן מבקר המדינה האם המפלגות והמועמדים ניהלו את חשבונותיהם לפי החוק והנחיותיו, האם ההוצאות לא עלו על הסכום המרבי המותר בחוק, והאם התרומות שהתקבלו עומדות במגבלות שקבע החוק לעניין זהות התורם וסכום התרומה.
מבקר המדינה מפרסם דוח על ממצאי בדיקתו, וקובע ביחס לכל מפלגה ולכל מועמד האם פעלו בהתאם להוראות החוק וההנחיות, כלומר האם הדוח בעניינם הוא חיובי או לא. על מועמדים בבחירות מקדימות ועל מפלגות וסיעות שלא התנהלו בהתאם למגבלות החוק ולהנחיות מבקר המדינה מוטלות סנקציות כספיות, בהתאם לממצאי הבדיקה של מבקר המדינה וקביעותיו, לרבות שלילת תשלום חלק מכספי המימון הממלכתי המגיע למפלגות או לסיעות.
על המועמדים לדווח למבקר המדינה על התרומות שהם מקבלים למימון מערכת הבחירות שלהם ומידע זה מתפרסם לידיעת הציבור באתר האינטרנט של משרד מבקר המדינה. רשימות התורמים, לאחר ביקורת מבקר המדינה, נכללות בדוח המבקר.