קליטת מטוסי כפיר - בחודשים אפריל-אוגוסט 1978 ערך משרד מבקר המדינה ביקורת על קליטתם של מטוסי כפיר בחיל האוויר. הביקורת נערכה בשתי טייסות, בבסיסים שונים, שקלטו מטוסים, ובטייסות התחזוקה של אותה הבסיסים. בדיקות השלמה נערכו בלהק אוויר ובלהק ציוד שבמיפקדת חיל האוויר.
ממצאי ביקורת הועלו בעיקר בתחומים הבאים: ייצור על פי אופיון וביצוע של שינויים ושיפורים, במסגרת של מיתקון חוזר; התאמתם של המטוסים לנשיאת טילים ומערכות לחימה אחרות; הצטיידות בחלקי חילוף; שמישות המטוסים; אימון צוותי האוויר והכשרת צוותי הקרקע. בדבר אימון צוותי האוויר העירה הביקורת, שאף אם היו האימונים בהיקף שנראה למיפקדת החיל מספיק, נכון היה לקיימם בהתאם לתקן כל עוד לא שונו התקנים.
ממצאי הביקורת נדונו עם מיפקדת חיל האוויר ועם מפקדי היחידות, שבהן נערכה הביקורת. ממצאים הנוגעים לתעשייה האווירית (תע"א) הובאו לידיעתה.
תחמושת לכוחות היבשה - בראשית מארס 1978 ניגש משרדי מבקר המדינה לערוך ביקורת על הטיפול בתחמושת; ב-6 במארס 1978 הודיע מטכ"ל/אג"א שהוא בעצמו החל בבדיקה ובשחזור של ההוראות הדנות בנושא ריענון תחמושת ביחידות, וביקש לדחות את מועד הביקורת. משרד מבקר המדינה נענה לבקשה. בחודשים אוקטובר-דצמבר 1978 ערך משרד מבקר המדינה ביקורת על סדרי הטיפול בתחמושת בשנים 1977 ו-1978. נבדקו סדרי האחסנה במרכזי תחזוקה קדמיים גדולים ובמחסנים של שתי חטיבות. בדיקת השלמה נעשתה במטכ"ל/אג"א ובמיפקדת קצין חימוש ראשי.
אבטחה ושמירה של מיתקנים - נספה לפקודות המטה הכללי, בעניין אבטחת מיתקני צה"ל והשמירה עליהם, קובע הנחיות בדבר הדרכים והשיטות לשמירת, הכוננות והביטחון במיתקני צה"ל. נוסף על כך הוציא מטכ"ל/אג"מ הוראות שונות בנושא. היעדים העיקריים ששמירתם היא על אחריותו של מפקד היחידה הם: כוח אדם, ציוד ובעיקר נשק, תחמושת, רכב, מצבורי דלק ומסמכים. בהתאם לפקודות חייב להיות בכל מיתקן תיק אבטחה, מאושר על ידי המינהלה המרחבית, שבו כלולות כל הפקודות הנוגעות לשמירת המיתקן והמידע הדרוש לאבטחתו.
בחודשים אפריל-ספטמבר 1978 ערך משרד מבקר המדינה, ביקורת על סדרי אבטחת מחנות ומיתקנים בשני פיקודים. נבדקו סדרי השמירה והאבטחה - במיוחד של בסיסי תחמושת ומחסני נשק; סדרי הכוננות למקרה פיגוע; הגידור ואמצעי אבטחה אחרים וכן סדרי הפיקוח והבקרה על ביצוע האבטחה בפועל. הביקורת נערכה בחמש מיפקדות בפיקוד א', וביניהן מיפקדת העורף של הפיקוד ובשני מחנות גדולים, שאחד מהם הוא מעבר לקו הירוק; בכל אחד מהמחנות חמש יחידות. בפיקוד ב' נערכה ביקורת בשלוש מיפקדות וביניהן מיפקדת העורף; בשלושה בסיסים, ובשלושה מחנות, שבגדול שביניהם יש עשר יחידות. דיווח מפורט על הליקויים, שהועלו נמסר ליחידות שנבדקו, למיפקדות הממונות עליהן ולמטה הכללי.