במיפקדות של איזור יהודה ושמרון ושל איזור חבל עזה וסיני נערכה ביקורת על פעולות שנעשו להטלת מיסים עקיפים ועל גבייתם.נערכה ביקורת על פעולות קצין המטה לענייני תובענות, האחראי לנושא זה באזורי המימשל הצבאי. נבדקו פעולות הביקורת הפנימית ביחידת מתאם הפעולה בשטחים ובמיפקדות האזורים של המימשל הצבאי.במיפקדות איזור יהודה ושומרון נבדקו ענייני תכנון, רישוי ופיקוח על הבנייה באיזור; ופעולות קצין המטה לענייני תחבורה. באיזור חבל עזה וצפון סיני נבדקו: פעולות הקשורות בהעברת המינהל האזרחי בצפון סיני לשלטון המצרי; ופעולות קצין המטה לענייני בריאות.