פרוייקט הקמה של מערכת -
א. בשנת 1981 מסר משרד הביטחון הזמנה לייצרן מקומי לייצור מערכת שתהווה חלק מתשתית של צה"ל. הזמנה זו לא עודכנה במשך שנים, אף על פי שבוצעו שינויים בעבודה. היעדר העדכונים גרם למעקב לקוי אחר ההיקף הכספי של השינויים שאושרו; הכיסוי הכספי של השינויים בוצע מנתח תקציבי, שהיה מיועד לרכש חלפים עבור המערכת.
ב. העיכוב עלול לגרום לקשיים חל עיכוב בהשגת תקציב חדש הדרוש לרכש חלפים בתפקוד המערכת.
ג. הקפאת בינוי של שני מתקנים מרכזיים, המיועדים למערכת, הייתה ארוכה בחמישה חודשים מתקופת ההקפאה שחלה על עבודות הקבלן הראשי. הדבר תרם להיווצרות פיגור בבינוי לעומת קצב העבודה של הקבלן הראשי, ובעקבותיו לתשלום נוסף לקבלן הראשי.
ד. הבנייה באחד המתקנים המרכזיים החלה רק 14 חודשים לאחר ששר הביטחון שיחרר את הבינוי מההקפאה.
ה. אין ביטוי במסמכים של משרד הביטחון לבדיקה מפורטת, שאמורה הייתה להיעשות על ידי המשרד בהתייחס לסכום של 8 מיליון דולר, אותו התחייב המשרד לשלם לקבלן הראשי לכיסוי ההוצאות שנגרמו לו עקב דחייה בלוח הזמנים.
בדיקת הזמנות לאספקת נעליים -
א. בהזמנות לנעלי צבא מסוגים שונים, התעורר במנה"ר חשש של הידברות ותיאום עמדות בין הייצרנים לקראת הגשת הצעותיהם. מנה"רי לא הפנה לכך את תשומת לבן של ועדות המכרזים ואלו לא נתנו את דעתן. על קיום החשש ולא העבירו את הנושא לטיפולם של הגופים המתאימים במשרד, כדי לערוך בדיקה יסודית של העובדות על מנת להזים את החשד או לאמתו, ולנקוט צעדים המתחייבים מכך.
ב. מנה"ר לא דאג לערוך בדיקה הנדסית מחודשת של המחירים במועד שנדרש בהוראותיו, ובמשך תקופה ארוכה, המשיך לבסס את הערכותיו לקראת מכרזים בדרך כלל על שיערוך של מחירים קודמים. לאחר עריכת הבדיקות, הצביעו תוצאותיהן על עלות ייצור נמוכה בהרבה מהמחיר שהמשרד שילם; אי-עריכת הבדיקות בזמן גרמה הפסד של מאות אלפי דולר למשרד.
הטלת מגבלות בנייה בגין מתקן ביטחוני - ב- 1985 החל אגף התכנון במטה הכללי של צה"ל לפעול להטלת מגבלות בנייה לגובה בפרוזדורים במטרה להבטיח פעולה תקינה עול מתקן בטחוני.
א. בקשה להטלת מגבלות בנייה לגובה, שהגישה מערכת הביטחון לוועדה למתקנים ביטחוניים במחוז א', תלויה ועומדת מתחילת 1985 , בלי שתיערך בדיקה מתאימה, האם היא מחייבת הכנסת הוראות שינוי בתכניות מיתאר מאושרות.
ב. לא הותקנו תקנות, כמתחייב מהוראות החוק, לעניין דרך הגשת התנגדויות להוראות שינוי על ידי אזרחים העלולים להיפגע מהן.
ג. שנה לאחר שהוועדה למתקנים ביטחוניים במחוז ב' החליטה להטיל מנבלות בנייה, היא עדיין לא הפיצה את החלטתה לוועדות המקומיות לתכנון ולבנייה.