הביקורת בנושא תכנון, מימון וביצוע מחקרים נערכה בחודשים מארס- יולי 1984 ופורסמה בדו"ח שנתי 35 , עמ' 373. הביקורת שפורסמה התמקדמה בנושאים האלה: העדר רישום מרוכז ושוטף בדבר כל נושאי המחקרים במגזר החקלאי ובפרט אלו הנעשים במכוני מחקר ציבוריים; היעדר נוהל מחייב בדבר העברת מידע על הצעות למחקר למוקדים השונים העוסקים באישור הצעות למחקרים; היעדר רישום מרוכז של המחקרים שאת תוצאותיהם אפשר ליישם; הצורך להגדיל את מספר המחקרים העוסקים בייעול ובשיפור הטיפול בתוצרת לאחר הקטיף. בנובמבר 1986, ערך משרד מבקר המדינה מעקב במינהל המחקר בבית-דגן, שתכליתו לבדוק באיזו מידה תוקנו הליקויים, שהועלו בדו"ח מבקר המדינה.